O Instituto possui um Departamento Científico, cuja função é promover atualização e aperfeiçoamento científico, tanto por meio de atividades internas quanto de eventos abertos ao público, além de estimular intercâmbios com outras instituições.

Entre as principais atividades estão:

• Reuniões Científicas — ocorrem regularmente e são espaços de discussão teórica entre psicanalistas e profissionais de outras áreas. Também servem para apresentação e debate da produção teórica e clínica dos próprios membros do Instituto.
• Cine Bion — sessões de filmes seguidas de discussão, abertas à comunidade. É uma proposta interessante porque aproxima a psicanálise de questões culturais e sociais.
• “Começando na Clínica: como eu faço” — voltado especialmente a estudantes no final da graduação e psicólogos recém-formados. Profissionais experientes compartilham situações, dúvidas e dificuldades do trabalho clínico.
• Grupos de Estudos — trabalham temas específicos, geralmente coordenados por membros do Instituto.
• Oficina e Práxis — procura aproximar conceitos psicanalíticos da prática clínica, criando espaço para reflexão sobre o fazer profissional.
• Jornada Científica — evento de maior porte realizado a cada dois anos, dedicado ao aprofundamento de determinados temas.